Endride menceritakan tentang Shun Asanaga, ia adalah siswa SMP berumur 15 tahun dengan kepribadian yang optimis dan ceria. Suatu hari, ia menemukan sebuah kristal misterius di kantor ayahnya, yang merupakan seorang ilmuwan dan pengusaha. Ketika ia menyentuhnya, dunia menjadi terdistorsi, dan ia dikirim ke dunia Endra.
Emilio, seorang pangeran dari kerajaan Endra yang memasuki ulang tahun ke-16, ia membenci raja memerintah saat ini yaiu Delzain. Sejak usia Emilio telah cukup untuk mewarisi takhta, ia mengambil senjata dan melakukan upaya balas dendam. Namun, karena Emilio terlalu lemah, ia ditangkap oleh Delzain dan dimasukkan ke dalam penjara. Ketika Emilio berada dalam kesedihan, dinding selnya terdistorsi dan Shun muncul dari sana dengan dua tujuan: kembali ke dunianya sendiri, dan menyelesaikan membalas dendam.